从营养成分上看，全脂奶粉作为鲜牛奶仅仅除去水分的代产品，具有鲜牛奶所有的一切营养成分，只是由于干燥损失了一部分热敏性的维生素，例如维生素C、E、B族等。而脱脂奶粉不仅仅是除去水分，而且除去绝大部分的乳脂肪，同时除去了脂溶性的维生素，例如维生素A、D、E等。由于脂肪含量的不同，造成全脂奶粉热量高于脱脂奶粉。

从营养价值上看，两种奶粉各有千秋。全脂奶粉营养全面、均衡，适合于一般消费者食用；脱脂奶粉脂肪含量低，蛋白质含量较高，尤其适合于需要补充高蛋白质的人群。